Kurze Antwort: Molekulargewicht = Summe der mittleren Restmassen + 18,015 Da für ein Wassermolekül an den freien Enden. Das Peptid MKTAYIAKQR wiegt etwa 1.209,5 Da (1,21 kDa). Als schnelle Schätzung für jedes Protein gelten etwa 110 Da pro Aminosäure, 300 Reste ergeben also rund 33 kDa.
Die Formel für das Molekulargewicht von Proteinen
MW = Σ Restmassen + 18,015 DaJede Peptidbindung setzt ein Wasser frei; eines wird für die Termini wieder addiertDer Rechner verwendet mittlere Restmassen, die die natürliche Isotopenverteilung abbilden und den Werten von ExPASy ProtParam entsprechen. In der Massenspektrometrie werden teils etwas niedrigere monoisotopische Massen verwendet.
MKTAYIAKQR
- Met 131,19 + Lys 128,17 + Thr 101,11 + Ala 71,08 + Tyr 163,18
- + Ile 113,16 + Ala 71,08 + Lys 128,17 + Gln 128,13 + Arg 156,19 = 1.191,46
- + Wasser 18,015 = 1.209,48 Da
Ergebnis: 1.209,48 Da (1,21 kDa)
Mittlere Restmassen der Aminosäuren
| Aminosäure | Code | Restmasse (Da) |
|---|---|---|
| Glycin | G | 57,05 |
| Alanin | A | 71,08 |
| Serin | S | 87,08 |
| Prolin | P | 97,12 |
| Valin | V | 99,13 |
| Threonin | T | 101,11 |
| Cystein | C | 103,14 |
| Leucin / Isoleucin | L / I | 113,16 |
| Asparagin | N | 114,10 |
| Aspartat | D | 115,09 |
| Glutamin | Q | 128,13 |
| Lysin | K | 128,17 |
| Glutamat | E | 129,12 |
| Methionin | M | 131,19 |
| Histidin | H | 137,14 |
| Phenylalanin | F | 147,18 |
| Arginin | R | 156,19 |
| Tyrosin | Y | 163,18 |
| Tryptophan | W | 186,21 |
Glycin ist der leichteste Rest, Tryptophan der schwerste. Der einfache Mittelwert der Tabelle liegt bei etwa 119 Da.
Schnelle Schätzung: die Regel 110 Da pro Rest
MW ≈ Reste × 110 DaNach Häufigkeit gewichteter Mittelwert in echten ProteinenKleine Reste wie Glycin, Alanin und Serin kommen viel häufiger vor als Tryptophan, was den Durchschnitt in echten Proteinen auf etwa 110 senkt. Ein Protein mit 607 Resten wie Serumalbumin kommt so auf etwa 67 kDa, tatsächlich sind es 66,5 kDa.
Typische Anwendungen
- SDS-PAGE-Gele auswerten anhand der erwarteten Größe.
- Experimente planen: Masse in Mol umrechnen für Puffer und Verdünnungen.
- Methodenteile schreiben für Paper und Abschlussarbeiten.
- Studium in Biologie und Biochemie.
- Synthetische Peptide bestellen mit der erwarteten Masse.
Was dieser Rechner nicht berücksichtigt
- Disulfidbrücken entfernen jeweils etwa 2 Da.
- Posttranslationale Modifikationen wie Glykosylierung fügen nicht vorhersagbare Masse hinzu.
- Terminale Modifikationen wie Amidierung verschieben die Masse um wenige Da.
- Nicht-Standard-Reste werden übersprungen.
Häufige Fragen
Wie wird das Molekulargewicht eines Proteins berechnet?
Addieren Sie die mittlere Restmasse jeder Aminosäure und dann ein Wasser (18,015 Da) für die freien Enden: MW = Σ Restmassen + 18,015.
Was sind Dalton und Kilodalton?
Ein Dalton (Da) ist die Einheit der Molekülmasse, etwa ein Wasserstoffatom. Ein Kilodalton (kDa) sind 1.000 Da.
Mittlere oder monoisotopische Masse?
Die mittlere Masse für das gesamte Molekulargewicht, wie hier. Die monoisotopische Masse wird in der hochauflösenden Massenspektrometrie verwendet und ist etwas niedriger.
Warum ist die Restmasse kleiner als die Masse der Aminosäure?
Jede Peptidbindung setzt ein Wasser frei. Die Restmasse ist die Aminosäure minus dieses Wasser.
Warum lautet die Faustregel 110 Da und nicht 119?
Der einfache Mittelwert der 20 Reste liegt bei etwa 119 Da, kleine Reste sind in echten Proteinen aber viel häufiger, daher liegt der gewichtete Mittelwert bei etwa 110.
Berücksichtigt der Rechner Disulfidbrücken oder Modifikationen?
Nein. Jede Disulfidbrücke entfernt etwa 2 Da, und Glykosylierung oder Phosphorylierung fügen Masse hinzu, die sich aus der Sequenz nicht vorhersagen lässt.
Verwandte Tools
Hinweis zur Genauigkeit: Die Restmassen sind Standard-Mittelwerte, geprüft an der Insulin-A-Kette. Berechnet wird die unmodifizierte Kette, prüfen Sie wichtige Werte daher mit einem spezialisierten Labortool.
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